Convalidaciones pruebas libres fp

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ResumenLa secuenciación del genoma completo (WGS) ha demostrado ser prometedora para convertirse en una prueba de diagnóstico de primer nivel para los pacientes con trastornos genéticos raros; sin embargo, faltan normas que aborden la definición y la práctica de despliegue de una prueba de primera clase. Para abordar estas lagunas, se formó la Iniciativa del Genoma Médico, un consorcio de organizaciones sanitarias y de investigación líderes en los Estados Unidos y Canadá, para ampliar el acceso a la WGS clínica de alta calidad mediante la publicación de las mejores prácticas. Aquí presentamos recomendaciones consensuadas sobre la validación analítica de la WGS clínica para el diagnóstico de individuos con sospecha de enfermedad de la línea germinal, centrándonos en el desarrollo de la prueba, las consideraciones iniciales para el diseño de la prueba, las prácticas de validación de la prueba y las métricas para supervisar el rendimiento de la prueba. Este trabajo también proporciona información sobre el estado actual de las pruebas de WGS en cada institución miembro, incluida la utilización de estándares de referencia y de otro tipo en todos los centros. Es importante destacar que los miembros de esta iniciativa creen firmemente que la WGS clínica es una prueba de primer nivel adecuada para los pacientes con trastornos genéticos raros y que, como mínimo, está preparada para sustituir al análisis de microarrays cromosómicos y a la secuenciación del exoma completo. Las recomendaciones presentadas aquí deberían reducir la carga de los laboratorios que introducen la WGS en la práctica clínica, y apoyar la realización de pruebas de WGS seguras y eficaces para el diagnóstico de enfermedades de la línea germinal.

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La disfunción tiroidea, que incluye la sobreactividad de la tiroides (hipertiroidismo) y la infraactividad (hipotiroidismo), es un importante trastorno hormonal con importantes implicaciones para la salud, y muchos pacientes con disfunción tiroidea no son diagnosticados formalmente. Nuestro objetivo es desarrollar un método informático para detectar a los pacientes con hipertiroidismo e hipotiroidismo que podrían beneficiarse de un tratamiento médico. Utilizamos datos de laboratorio rutinarios y un programa informático especializado para detectar la disfunción tiroidea en los pacientes. Demostramos que podemos hacerlo con exactitud, por lo que podríamos utilizar nuestro sistema para detectar a los pacientes basándonos en los datos de las pruebas médicas rutinarias. Sin embargo, es necesario realizar más pruebas en estudios clínicos antes de que nuestro enfoque pueda utilizarse en la clínica.

Cada institución es propietaria de los datos de su propia institución, y se aplican restricciones a la disponibilidad de estos datos, que se utilizaron bajo licencia para el estudio actual y, por lo tanto, no están disponibles públicamente. Sin embargo, los datos están disponibles a través de los autores previa solicitud razonable y con el permiso de cada instituto. Los datos fuente de la Fig. 1 están disponibles como archivo excel «Figure1.xlsx» en nuestro sitio GitHub: https://github.com/CosmicAITS/AITS1.

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Rango linealTanto los ensayos basados en ARNm de DLX1 como los de HOXC6 fueron lineales en todo el rango de diluciones, tal y como establecen los coeficientes no significativos de las variables cúbicas y cuadráticas (P > 0,05) en los análisis de regresión polinómica de segundo y tercer orden (Tabla 4). Los valores Cp oscilaron entre 16,74 y 36,49 (correspondientes a 107-16 copias/RT-PCR) para DLX1, y entre 16,40 y 36,30 (correspondientes a 107-32 copias/RT-PCR) para HOXC6.Tabla 4

Dado que las variables cúbica y cuadrática fueron estadísticamente significativas para KLK3 (P < 0,001), este ensayo no se consideró lineal cuando se tuvieron en cuenta las siete concentraciones (Tabla 4). Si sólo se incluían cinco diluciones con ≥1000 copias de KLK3/RT-PCR, el ensayo era lineal. Para asegurar un material de entrada suficiente para el ensayo clínico, es necesario que haya un mínimo de 10.000 copias de KLK3. La desviación de la linealidad (DLi) se evaluó para el ensayo basado en el ARNm de KLK3. Cuando se tuvieron en cuenta las siete concentraciones, la DLi estaba dentro de los límites preestablecidos y, por lo tanto, el ensayo de KLK3 se consideró suficientemente lineal, incluso cuando había menos de 1.000 copias presentes (Fig. 1).Fig. 1La DLi determinada para el ensayo de ARNm de KLK3 se ilustra mediante este gráfico en el que la DLi media (asterisco rojo) y el IC del 95% se representan frente a la concentración de ARN para cada muestraImagen completa

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4#endif#define MAX_FIELDS 32typedef struct { const char *nombre; size_t sz;} field_desc_t;typedef struct { const char *nombre; size_t sz; size_t bitfield_sz; size_t abi_sz; field_desc_t fields[MAX_FIELDS];} struct_desc_t;#define LAST_STRUCT { .name = NULL, }#define FIELD(n, st) \ { . name = #n, \ .sz = sizeof((st *)(0))->n), \ }#define LAST_FIELD { .name = NULL, }static const struct_desc_t pfmlib_structs[]= { .name = «pfm_pmu_info_t», .sz = sizeof(pfm_pmu_info_t), .bitfield_sz = 4, .abi_sz = PFM_PMU_INFO_ABI0, .fields= {